2016年1月29日，科技部、財政部、國家稅務總局以國科發火〔2016〕32號印發修訂后的《高新技術企業認定管理辦法》。該《辦法》分總則、組織與實施、認定條件與程序、監督管理、附則5章23條，由科技部、財政部、稅務總局負責解釋，自2016年1月1日起實施。2008年印發的《高新技術企業認定管理辦法》(國科發火〔2008〕172號)予以廢止。